Взято на сайте Webmin
Типа перевел

Используя находящуюся в составе дистрибутива программку changepass.pl, установим пользователю “admin” пароль “foo”:

Для Linux:
/usr/libexec/webmin/changepass.pl /etc/webmin admin foo

Для FreeBSD (версия 9.x), webmin ставился из портов в дефолтное расположение:
/usr/local/lib/webmin/changepass.pl /usr/local/etc/webmin admin foo