Взято здесь: http://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/resetting-permissions.html

1. Завершить MySQL
2. Создать фал для сброса пароля. Предположим, это /home/user/mysql_reset. В зависимости от версии MySQL-я, он состоит из следующей строки. В зависимости от версии MySQL, строка пишется так:
   1. MySQL версия 5.7.5 и ниже:

      SET PASSWORD FOR 'root'@'localhost' = PASSWORD('MyNewPass');

   2. MySQL версия 5.7.6 и выше:

      ALTER USER 'root'@'localhost' IDENTIFIED BY 'MyNewPass';

3. Теперь заводим MySQL, скормив ему на старте наш файл сброса пароля:

   mysqld_safe --init-file=/home/user/mysql_reset &

После входа в MySQL, он может потребовать опять сменить пароль, но уже по-новому:

ERROR 1820 (HY000): You must reset your password using ALTER USER statement before executing this statement.

Тогда, поскольку мы вошли с помощью

mysql - u root -p

с легким сердцем соглашаемся:

ALTER USER 'root'@'localhost' IDENTIFIED BY 'MyNewPass';
FLUSH PRIVILEGES;
quit